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2026年9月20日,《自然》旗下期刊《科学报告》(Scientific Reports)发表日本东京大学团队的研究"Comparative genomics of Actinomyces identifies an MRONJ-associated lineage characterized by variation in mfd"。研究利用选择性培养基从多家医院的53例药物相关颌骨坏死(MRONJ)患者口腔标本中分离放线菌,结合短读长与纳米孔长读长测序完成基因组解析,发现多数MRONJ来源菌株聚类于以Actinomyces oris为主导、并以mfd基因特定变异为特征的一个谱系,为MRONJ的微生物学关联提供了迄今最系统的基因组学证据。

1. 一个悬而未决的"菌—病"关联
药物相关颌骨坏死(medication-related osteonecrosis of the jaw, MRONJ)是双膦酸盐、地舒单抗及部分抗血管生成药物相关的一类严重骨并发症,表现为颌骨坏死、疼痛、感染,严重影响患者生活质量。尽管病理生理机制尚未完全阐明,既往组织学与宏基因组研究已多次提示放线菌(Actinomyces)与MRONJ存在关联,但受限于样本量小、缺乏选择性分离培养基,这一关联始终缺乏有力的基因组学验证。
本研究的价值,正在于同时补齐了"怎么分离"与"怎么测序"两个技术缺口:一方面采用新开发的选择性培养基高效富集放线菌;另一方面针对放线菌特性开发DNA提取方案,并同时采用短读长与最新的纳米孔长读长测序,实现了菌株级的完整基因组解析。
2. 一个mfd变异标记的谱系浮出水面
通过比较基因组分析——包括重建完整的参考染色体——团队发现,多数MRONJ来源的分离株聚集在同一个以Actinomyces oris为主导的谱系内,且该谱系以一个特定的mfd基因变异为特征。mfd基因此前已被认为与细菌的"可进化性"(evolvability)相关,是参与转录偶联DNA修复的关键因子。进一步的三维结构预测显示,这些分离株的Mfd蛋白可能存在结构差异,但其功能意义以及与MRONJ的因果关系仍有待阐明。
研究覆盖53例患者、跨多家医院,是迄今该方向样本量较大、方法学较完整的工作。需要客观指出的是,这是一项描述性/关联性研究,尚不能回答"放线菌是MRONJ的病因还是继发定植"这一核心因果问题;mfd变异是驱动因素还是伴随现象,也需要功能实验与更大规模队列的验证。
3. 对临床与微生物组研究的启示
对临床而言,这项研究为"MRONJ与特定微生物谱系相关"提供了更硬的基因组证据,未来或可据此开发针对高危患者的口腔微生物筛查或早期预警指标;对科研端而言,其"选择性培养基 + 长读长测序 + 比较基因组"的组合,为研究难培养、低丰度的口腔/骨感染相关微生物提供了一个可复用的技术范式。在长读长测序日益普及的背景下,把菌株级分辨率引入临床微生物关联研究,正成为从"看菌群组成"走向"看菌株功能变异"的下一站。
来源:《科学报告》研究论文、东京大学团队发布

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- 1. 一个悬而未决的"菌—病"关联
- 2. 一个mfd变异标记的谱系浮出水面
- 3. 对临床与微生物组研究的启示






