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山东大学微生物改造技术全国重点实验室佘群新教授、冯旭研究员团队与华中农业大学韩文元教授团队合作,在《Cell Reports》在线发表研究,系统解析了自然界分布最广的 I 型 CRISPR-Cas 系统中、组分最为丰富的 I-A 亚型的多层级活性调控机制,提出"靶标依赖的 Cas3 招募激活"新模型,并首次揭示 ATP 在该过程中的双向调控作用。

2026年8月16日资讯,山东大学微生物改造技术全国重点实验室佘群新教授、冯旭研究员团队与华中农业大学韩文元教授团队合作,在《Cell Reports》在线发表研究,系统解析了自然界分布最广的 I 型 CRISPR-Cas 系统中、组分最为丰富的 I-A 亚型的多层级活性调控机制,提出"靶标依赖的 Cas3 招募激活"新模型,并首次揭示 ATP 在该过程中的双向调控作用。


1. 攻克最复杂的 CRISPR 亚型

CRISPR-Cas 系统是原核生物抵御噬菌体及外源质粒入侵的适应性免疫系统,其机制阐明直接推动了基因编辑技术的革命。其中,I 型系统在自然界分布最广,但组成复杂,长期制约对其工作机制的理解。

I-A 亚型尤为棘手:它不仅拥有最丰富的 Cas 蛋白组分,负责 DNA 切割的 Cas3 蛋白还进一步演化为两个独立亚基,分子作用机制此前一直未被完整解析。研究团队以冰岛硫化叶菌(Saccharolobus islandicus)的 I-A 型系统为模型,成功从天然宿主中分离纯化出内源性 Cascade 复合物(CRISPR-associated complex for antiviral defense),为后续解析奠定基础。

2. "招募激活"新模型:与已知系统的机制分化

研究发现,无靶标时,多个 Cas 蛋白组装形成缺乏 Cas6(CRISPR RNA 加工酶)与 Cas3 核酸酶的 Cascade 复合物;仅当 Cascade 识别靶标 DNA 后,才招募 Cas3,进而触发其 ATP 酶活性、解旋酶活性及对靶标的持续性切割能力。

这一"诱导招募"模式,与已报道的激烈火球菌(Pyrococcus furiosus)I-A 系统采用的"预结合-去抑制"策略(Cas3 始终与 Cascade 预结合,靶标识别后才解除自我抑制)形成鲜明对比。两项研究共同揭示了同一亚型内不同菌株间 CRISPR 激活策略的多样性,也表明"靶标识别后招募 Cas3"可能是 I 型系统普遍采用的激活逻辑。

3. ATP 的双向调控:既杀敌,也防自伤

Cas3 属于非特异性核酸酶,一旦失控即可能无差别切割宿主基因组,导致自身免疫损伤。本研究揭示了生理浓度下 ATP 对 Cas3 活性的双向精准调控:

一方面,ATP 特异性促进 Cas3 对靶标 DNA 的持续性切割,保障对入侵病毒的高效清除;另一方面,ATP 同时抑制 Cas3 激活后的非特异性单链切割(旁切)活性,并遏制游离 Cas3 蛋白的本底核酸酶活性,从而在确保病毒 DNA 精准切割的同时,最大限度降低自免疫风险。

这一发现为未来 CRISPR 工具的活性精细调控与安全性优化提供了全新设计思路,也深化了对微生物—病毒互作机制的理解。论文第一作者为博士研究生蒋素平,DOI:10.1016/j.celrep.2026.117820。

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